キトは1日の中で気温の変化が大きく、日中は日差しが強くTシャツ1枚でも過ごせますが、朝晩は寒いこともあるので、薄手のセーターやカーディガンもご用意ください。ガラパゴス、グアヤキルは1年中摂氏20℃を超えますので、夏服で大丈夫です。日中は日差しが強いので、日焼け止め対策も忘れずに。また、上陸時は徒歩で観光しますので、動きやすい服装をご用意ください。履物は、溶岩の上を歩きますので、運動靴やトレッキングシューズが最適です。また、帰路にビーチに寄ることがありますのでビーチサンダルも必須。虫さされや日焼けが気になる方は長袖のTシャツ、長いパンツをご用意ください。Tシャツ、靴下、下着などは水に濡れた場合の着替え用に多めにご用意ください。水着、シュノーケリング（レンタルあり。1日10ドル程度）もお持ちいただけるとよいでしょう。

ガラパゴス諸島への来島者は、バルトラ空港またはサンクリストバル空港に到着すると、入島者管理→入島料支払→検疫の手順で進みます。ガラパゴス諸島を訪れる12歳以上の外国人旅行者は、ガラパゴスへの到着時に1人あたりUS$100（2007年7月現在）をお支払いいただきます。

国立公園内は、自然と生物の保護保全のために規制レベルを4段階（厳正保護区域、原始区域、探訪可能区域、特定利用区域）に区分けしています。観光の際には、1人のナチュラリストと呼ばれる公認ガイドが原則16名ずつ担当して上陸。島内では、トレイルと呼ばれる歩行路を定めて、自然の生態系が壊されないように保全しています。